MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 33561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_003552	A	8	8	5737212	5737219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33502	NC_003552	TA	3	6	5737253	5737258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33503	NC_003552	GAA	2	6	5737315	5737320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33504	NC_003552	GAAAAG	2	12	5737382	5737393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33505	NC_003552	CCCAGA	2	12	5738183	5738194	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33506	NC_003552	TGTC	2	8	5738223	5738230	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33507	NC_003552	TAA	2	6	5738369	5738374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33508	NC_003552	ATT	2	6	5738394	5738399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33509	NC_003552	ACA	2	6	5738442	5738447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33510	NC_003552	A	6	6	5738468	5738473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33511	NC_003552	TGA	2	6	5739320	5739325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33512	NC_003552	AG	3	6	5739341	5739346	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33513	NC_003552	TTC	2	6	5739351	5739356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33514	NC_003552	TAAT	2	8	5739454	5739461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33515	NC_003552	AACA	2	8	5739476	5739483	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33516	NC_003552	AAGT	2	8	5739485	5739492	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33517	NC_003552	GA	3	6	5739507	5739512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33518	NC_003552	TGTT	2	8	5739529	5739536	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33519	NC_003552	A	6	6	5739584	5739589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33520	NC_003552	GAT	2	6	5739619	5739624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33521	NC_003552	GAA	2	6	5739625	5739630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33522	NC_003552	A	6	6	5740756	5740761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33523	NC_003552	AGG	2	6	5740791	5740796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33524	NC_003552	CTT	2	6	5740801	5740806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33525	NC_003552	TA	3	6	5741055	5741060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33526	NC_003552	AGG	2	6	5741073	5741078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33527	NC_003552	GAA	2	6	5741965	5741970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33528	NC_003552	AATA	2	8	5742021	5742028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33529	NC_003552	ATA	2	6	5742036	5742041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33530	NC_003552	TA	3	6	5742089	5742094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33531	NC_003552	A	7	7	5742099	5742105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33532	NC_003552	AAG	2	6	5742133	5742138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33533	NC_003552	AG	3	6	5743030	5743035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33534	NC_003552	A	6	6	5743038	5743043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33535	NC_003552	TAG	2	6	5743161	5743166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33536	NC_003552	GTT	2	6	5743193	5743198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33537	NC_003552	AGA	2	6	5744058	5744063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33538	NC_003552	AAAC	2	8	5744117	5744124	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33539	NC_003552	AAGA	2	8	5744171	5744178	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33540	NC_003552	T	6	6	5745415	5745420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33541	NC_003552	CTT	2	6	5745439	5745444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33542	NC_003552	T	6	6	5745452	5745457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33543	NC_003552	CTTTT	2	10	5745470	5745479	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33544	NC_003552	TCTT	2	8	5745492	5745499	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33545	NC_003552	AT	3	6	5745548	5745553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33546	NC_003552	A	6	6	5745638	5745643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33547	NC_003552	ACT	2	6	5745705	5745710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33548	NC_003552	CAA	2	6	5745712	5745717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33549	NC_003552	CATA	2	8	5745733	5745740	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33550	NC_003552	A	6	6	5746868	5746873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33551	NC_003552	A	6	6	5746938	5746943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33552	NC_003552	A	6	6	5747456	5747461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33553	NC_003552	AG	3	6	5747535	5747540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33554	NC_003552	AAC	3	9	5747562	5747570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33555	NC_003552	TTG	2	6	5747585	5747590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33556	NC_003552	AGG	2	6	5747837	5747842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33557	NC_003552	ATT	2	6	5747866	5747871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33558	NC_003552	TTTC	2	8	5749803	5749810	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33559	NC_003552	TTC	2	6	5749840	5749845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33560	NC_003552	T	7	7	5750554	5750560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33561	NC_003552	ATT	2	6	5751466	5751471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.